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福建:日本團隊開發(fā)出用少量DNA即可解析長鏈DNA甲基化的方法

   2021-07-08 福建省科學技術廳門戶網(wǎng)站
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核心提示:東京大學鈴木穰教授等開發(fā)了僅用少量DNA即可對長鏈DNA甲基化進行解析的方法。采用該方法僅需10納克左右DNA

東京大學鈴木穰教授等開發(fā)了僅用少量DNA即可對長鏈DNA甲基化進行解析的方法。采用該方法僅需10納克左右DNA(約相當于傳統(tǒng)方式的百分之一)便能對與疾病、發(fā)育或分化相關的甲基化狀況進行分析。該成果將使得基于少量臨床樣本或少數(shù)幾個細胞的醫(yī)學分析成為可能,有望對提升疾病治療水平,推動細胞分化研究進步作出貢獻。

傳統(tǒng)的DNA甲基化分析法只能讀取短DNA,無法解析長DNA的甲基化狀態(tài)。而納米孔測序法雖然可通過DNA在小孔穿過時產(chǎn)生的電流變化來讀取序列,但它在解析長鏈DNA時需要約1微克的DNA才行。該研究團隊將堿基轉化法和納米孔測序相結合,使用酶將基因組DNA轉化為堿基,再通過PCR技術使全基因組擴增,然后再采用納米孔測序儀讀取序列,于是做到用少量的DNA量即能對長鏈DNA的甲基化狀態(tài)進行檢測分析。

在實驗中,研究團隊使用上述方法對乳腺癌臨床標本的大約25納克DNA進行了分析,結果成功檢測到乳腺癌特異性甲基化模式和結構變異周邊的甲基化模式。

(來源:福建省科學技術廳門戶網(wǎng)站)


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