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瑞典制藥公司科學(xué)家設(shè)計(jì)出規(guī)避CRISPR脫靶效應(yīng)方案

   2018-10-10 互聯(lián)網(wǎng)綜合消息
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核心提示:瑞典阿斯利康公司的生物學(xué)家Marcello Maresca與美國(guó)科學(xué)家J. K Joung合作,在9月12日的Nature Letter上發(fā)文
  瑞典阿斯利康公司的生物學(xué)家Marcello Maresca與美國(guó)科學(xué)家J. K Joung合作,在9月12日的Nature Letter上發(fā)文表示,他們?cè)O(shè)計(jì)出了一種可有效規(guī)避CRISPR脫靶效應(yīng)的方案。在小鼠體內(nèi)進(jìn)行的研究表明,利用他們體內(nèi)非靶點(diǎn)驗(yàn)證VIVO 策略(verification of in vivo off-targets)可以穩(wěn)定地鑒定出CRISPR在體內(nèi)全基因組中的脫靶效應(yīng)。
  作為最受關(guān)注的基因編輯“魔剪”,CRISPR技術(shù)顯示了無(wú)限的臨床應(yīng)用潛力,但近兩年來(lái)多項(xiàng)研究卻指出其存在“亂剪”的巨大風(fēng)險(xiǎn)(脫靶效應(yīng))。一直以來(lái)基于基因比對(duì)的脫靶效應(yīng)預(yù)測(cè)軟件,則不能完全讓人放心。
  J. K Joung團(tuán)隊(duì)于2017年發(fā)明了一種有效檢驗(yàn)CRISPR脫靶效應(yīng)的體外驗(yàn)證方法(Nat. Methods 14, 607–614)。他們以小鼠基因組為研究對(duì)象,在體外將其DNA剪切成片段,每個(gè)片段約包含300個(gè)堿基對(duì),然后連接adapters使DNA成環(huán)。隨后,他們引入一個(gè)CRISPR-Cas9和引導(dǎo)RNA復(fù)合體,進(jìn)行切割,使其線性化。最后,加入另一種只剪切閉環(huán)DNA的核酸酶用來(lái)降解未被切割的環(huán)狀DNA,體系中就只剩下線性的(即被CRISPR-Cas9切割了的)DNA用于測(cè)序,就可以確定哪些位點(diǎn)被CRISPR-Cas9剪切了。
  Marcello Maresca等將這種體外驗(yàn)證方法的結(jié)論在小鼠體內(nèi)試驗(yàn)中進(jìn)行了驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)脫靶效應(yīng)在體內(nèi)外是高度吻合的。因此,只需要設(shè)計(jì)對(duì)靶點(diǎn)高度特異性的引導(dǎo)RNA,并利用VIVO進(jìn)行驗(yàn)證(沒(méi)有脫靶效應(yīng)),便可以規(guī)避CRISPR脫靶效應(yīng)。
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