2019年9月17日,梅奧診所(Mayo Clinic)的孫杰團隊在Immunity 期刊上發(fā)表了題為“The transcription factor Bhlhe40 programs mitochondrial regulation of resident CD8+ T cell fitness and functionality”的論文,闡明了在轉(zhuǎn)錄因子Bhlhe40調(diào)控下的一系列表觀遺傳修飾與代謝過程對于Trm與TIL細胞發(fā)揮功能和免疫檢查點阻斷治療響應(yīng)性有重要作用,并根據(jù)這一機制,通過體外篩選獲得了一組促進腫瘤浸潤CD8+T細胞組織駐留功能從而有效抑制實體腫瘤生長的小分子化合物,有望對腫瘤免疫治療起到有效促進。
首先通過對腫瘤病人臨床樣本以及小鼠CD8+ T細胞分析,研究者發(fā)現(xiàn)相較于循環(huán)或免疫器官中的CD8+ T細胞,Trm與TIL細胞均高表達轉(zhuǎn)錄因子Bhlhe40及其相關(guān)基因簇。對于Bhlhe40缺失小鼠進行病毒感染以及腫瘤接種,研究者發(fā)現(xiàn)在流感病毒感染過程中,Bhlhe40缺失并不影響效應(yīng)性CD8+ T細胞與脾臟記憶性CD8+ T細胞的功能,卻特異性地降低了肺中的Trm細胞數(shù)量,從而使得Bhlhe40缺失小鼠在二次流感感染中難以得到由Trm細胞介導(dǎo)的有效保護。而在皮下接種腫瘤實驗中, 作者發(fā)現(xiàn)Bhlhe40缺失CD8+ T細胞在腫瘤生長后期顯示出了較差的抗腫瘤能力,從而難以有效抑制腫瘤生長。通過對于Bhlhe40上游信號分析,作者發(fā)現(xiàn)PD-1-PD-L1信號通路顯著抑制Bhlhe40表達,并且Bhlhe40缺失的荷瘤小鼠對于PD-L1抗體治療并不響應(yīng),這也預(yù)示Bhlhe40在TIL細胞中的表達水平有潛力成為免疫檢查點阻斷治療效果的預(yù)測指標(biāo)。
作者進一步對Bhlhe40的作用機制進行了研究,通過RNA-seq以及代謝組學(xué)分析, 作者發(fā)現(xiàn)Bhlhe40作為轉(zhuǎn)錄因子,可以結(jié)合在一系列線粒體相關(guān)基因啟動子上,從而調(diào)控線粒體氧化呼吸功能;Bhlhe40缺失CD8+ T細胞下調(diào)了包括三羧酸循環(huán)等線粒體代謝途徑,從而使得代謝中間產(chǎn)物乙酰輔酶A (Ace-CoA) 產(chǎn)生受阻。Ace-CoA除作為代謝中間產(chǎn)物完成細胞能量代謝外,仍具有重要的的調(diào)控作用, 是表觀遺傳調(diào)控中組蛋白乙酰化修飾(基因轉(zhuǎn)錄活化的前提條件)的重要底物,因此Bhlhe40缺失CD8+ T細胞中細胞因子與效應(yīng)分子基因轉(zhuǎn)錄均因此受到了影響,從而導(dǎo)致了Trm與TIL細胞的功能損傷。為了彌補由于Bhlhe40缺失引起的Trm與TIL細胞功能損傷,作者通過體外實驗篩選表觀遺傳調(diào)控化合物庫,發(fā)現(xiàn)組蛋白去乙?;福℉DAC)抑制劑Tubastatin-A 與乙酸鈉(組蛋白乙酰化另一重要底物)聯(lián)合使用(TA/AC)可以有效促進Bhlhe40缺失CD8+ T細胞效應(yīng)功能與組織駐留能力,并能夠提升正常CD8+ T細胞的這一系列能力。
該項研究表明非淋巴組織與腫瘤中駐留的CD8+ T細胞通過上調(diào)轉(zhuǎn)錄因子Bhlhe40的表達水平來維持自身的代謝與表觀遺傳修飾,從而有效響應(yīng)再次感染以及腫瘤免疫檢查點治療;并且通過這一機制,為日后腫瘤免疫治療效果預(yù)測以及藥物篩選提供了新思路。
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首先通過對腫瘤病人臨床樣本以及小鼠CD8+ T細胞分析,研究者發(fā)現(xiàn)相較于循環(huán)或免疫器官中的CD8+ T細胞,Trm與TIL細胞均高表達轉(zhuǎn)錄因子Bhlhe40及其相關(guān)基因簇。對于Bhlhe40缺失小鼠進行病毒感染以及腫瘤接種,研究者發(fā)現(xiàn)在流感病毒感染過程中,Bhlhe40缺失并不影響效應(yīng)性CD8+ T細胞與脾臟記憶性CD8+ T細胞的功能,卻特異性地降低了肺中的Trm細胞數(shù)量,從而使得Bhlhe40缺失小鼠在二次流感感染中難以得到由Trm細胞介導(dǎo)的有效保護。而在皮下接種腫瘤實驗中, 作者發(fā)現(xiàn)Bhlhe40缺失CD8+ T細胞在腫瘤生長后期顯示出了較差的抗腫瘤能力,從而難以有效抑制腫瘤生長。通過對于Bhlhe40上游信號分析,作者發(fā)現(xiàn)PD-1-PD-L1信號通路顯著抑制Bhlhe40表達,并且Bhlhe40缺失的荷瘤小鼠對于PD-L1抗體治療并不響應(yīng),這也預(yù)示Bhlhe40在TIL細胞中的表達水平有潛力成為免疫檢查點阻斷治療效果的預(yù)測指標(biāo)。
作者進一步對Bhlhe40的作用機制進行了研究,通過RNA-seq以及代謝組學(xué)分析, 作者發(fā)現(xiàn)Bhlhe40作為轉(zhuǎn)錄因子,可以結(jié)合在一系列線粒體相關(guān)基因啟動子上,從而調(diào)控線粒體氧化呼吸功能;Bhlhe40缺失CD8+ T細胞下調(diào)了包括三羧酸循環(huán)等線粒體代謝途徑,從而使得代謝中間產(chǎn)物乙酰輔酶A (Ace-CoA) 產(chǎn)生受阻。Ace-CoA除作為代謝中間產(chǎn)物完成細胞能量代謝外,仍具有重要的的調(diào)控作用, 是表觀遺傳調(diào)控中組蛋白乙酰化修飾(基因轉(zhuǎn)錄活化的前提條件)的重要底物,因此Bhlhe40缺失CD8+ T細胞中細胞因子與效應(yīng)分子基因轉(zhuǎn)錄均因此受到了影響,從而導(dǎo)致了Trm與TIL細胞的功能損傷。為了彌補由于Bhlhe40缺失引起的Trm與TIL細胞功能損傷,作者通過體外實驗篩選表觀遺傳調(diào)控化合物庫,發(fā)現(xiàn)組蛋白去乙?;福℉DAC)抑制劑Tubastatin-A 與乙酸鈉(組蛋白乙酰化另一重要底物)聯(lián)合使用(TA/AC)可以有效促進Bhlhe40缺失CD8+ T細胞效應(yīng)功能與組織駐留能力,并能夠提升正常CD8+ T細胞的這一系列能力。
該項研究表明非淋巴組織與腫瘤中駐留的CD8+ T細胞通過上調(diào)轉(zhuǎn)錄因子Bhlhe40的表達水平來維持自身的代謝與表觀遺傳修飾,從而有效響應(yīng)再次感染以及腫瘤免疫檢查點治療;并且通過這一機制,為日后腫瘤免疫治療效果預(yù)測以及藥物篩選提供了新思路。
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