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南京醫(yī)科大學(xué)研究人員鑒定肺癌風(fēng)險(xiǎn)篩查和臨床預(yù)后的潛在生物標(biāo)志物

   2019-07-19 互聯(lián)網(wǎng)綜合消息
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核心提示:  肺癌是最常見的癌癥類型,發(fā)病機(jī)制復(fù)雜,具有高度異質(zhì)性,遺傳因素在肺癌發(fā)生和發(fā)展中發(fā)揮重要作用,但

  肺癌是最常見的癌癥類型,發(fā)病機(jī)制復(fù)雜,具有高度異質(zhì)性,遺傳因素在肺癌發(fā)生和發(fā)展中發(fā)揮重要作用,其具體遺傳機(jī)制尚不清楚。增強(qiáng)子元件是一類特定的DNA序列,其序列富含轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn),并具有特異性的表觀遺傳修飾標(biāo)記,通過形成染色質(zhì)環(huán)高級(jí)結(jié)構(gòu)與靶基因啟動(dòng)子相互作用,實(shí)現(xiàn)對(duì)靶基因的遠(yuǎn)程調(diào)控,是基因組中調(diào)控基因表達(dá)的關(guān)鍵元件。增強(qiáng)子遺傳變異可增加個(gè)體對(duì)特定復(fù)雜性疾病的易感性,是多種人類疾病的重要遺傳基礎(chǔ)。

  南京醫(yī)科大學(xué)孫玉潔教授課題組與沈洪兵教授課題組及宋鑫教授課題組合作,以既往研究發(fā)現(xiàn)的中國人群肺癌風(fēng)險(xiǎn)單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)(Single Nucleotide Polymorphism,SNP) rs753955 (A>G)為遺傳標(biāo)記,通過體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)探討了染色體13q12.12風(fēng)險(xiǎn)基因座遺傳背后的生物學(xué)意義及潛在機(jī)制,該研究工作于2019年5月發(fā)表于Genome Biology。

  該研究結(jié)果表明,染色體13q12.12風(fēng)險(xiǎn)基因座區(qū)域內(nèi)含有一個(gè)p53響應(yīng)性增強(qiáng)子元件,可通過形成染色質(zhì)環(huán)結(jié)構(gòu)遠(yuǎn)程調(diào)控其靶基因TNFRSF19 的表達(dá)水平,有效抑制致癌物誘導(dǎo)的DNA損傷和細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化。而染色體13q12.12風(fēng)險(xiǎn)基因座區(qū)域內(nèi) rs17336602(G>C),rs4770489(A>G)和 rs34354770(A>C)三個(gè)常見遺傳變異可通過降低該增強(qiáng)子的p53響應(yīng)性從而導(dǎo)致肺癌風(fēng)險(xiǎn)和疾病發(fā)展。

  該研究為解析肺癌的遺傳機(jī)制提供了新的依據(jù),同時(shí)提示13q-Enh增強(qiáng)子和TNFRSF19可以作為肺癌風(fēng)險(xiǎn)篩查和臨床預(yù)后的潛在生物標(biāo)志物。

原文地址:https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-019-1696-1


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