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萊布尼茨學(xué)會分析科學(xué)研究所開發(fā)新軟件首次實現(xiàn)自動檢測蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)

   2015-03-02 互聯(lián)網(wǎng)綜合消息
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核心提示:萊布尼茨學(xué)會分析科學(xué)研究所的研究人員將可能解決現(xiàn)代生命科學(xué)的重要難題:在大量的蛋白質(zhì)原始數(shù)據(jù)組中自動
  萊布尼茨學(xué)會分析科學(xué)研究所的研究人員將可能解決現(xiàn)代生命科學(xué)的重要難題:在大量的蛋白質(zhì)原始數(shù)據(jù)組中自動檢測公開的數(shù)據(jù)庫中未被開發(fā)利用的數(shù)據(jù)。由于數(shù)據(jù)格式多樣、數(shù)量龐大,精確查找這些數(shù)據(jù)一直以來都相當(dāng)復(fù)雜。萊布尼茨學(xué)會分析科學(xué)研究所的研究人員在最新一期《自然生物技術(shù)》(“Natrue Biotechnology”)期刊中表示已研發(fā)出新軟件,可以自動將數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為統(tǒng)一格式并同時開展評估和運(yùn)用。
  現(xiàn)今重要的數(shù)據(jù)分析手段之一是質(zhì)譜分析法,從諸如細(xì)胞或組織的繁雜大生物分子中分析各自組成及其數(shù)量和變化。通過質(zhì)譜分析法可以將混合物的不同成分根據(jù)質(zhì)量分離出來,從而得到其濃度和組成。通過這一方法,科學(xué)家們雖然可以分析大量樣本,但已存在的數(shù)據(jù)在實際操作中被再次分析和使用的難度很大。大部分?jǐn)?shù)據(jù)仍然處于未開發(fā)狀態(tài),其價值也尚未被世人充分利用。
  萊布尼茨學(xué)會分析科學(xué)研究所的科研人員為此開發(fā)出了“多肽振動篩”程序。這個程序原本只用于捕捉大量原始數(shù)據(jù)。很快科學(xué)家們就意識到,“多肽振動篩”程序可以自動對公開的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫中數(shù)據(jù)進(jìn)行評估運(yùn)用,從而使得蛋白質(zhì)組的完整數(shù)據(jù)周期首次展現(xiàn)在世人面前成為可能。
  與其他軟件只有一種算法不同,這個軟件同時使用多種算法,提高其分析結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。
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